高级企业版超级系统中心是为了满足（超）大型企业跨区域网络的病毒防护系统而开发的，它采用分级的层次化管理，上级中心能够控制和管理其下级中心及其下属任意一个客户端。每一级中心既作为一个独立的网络防病毒中心运行，又同其上下级中心共同构成一个完整的防病毒系统。统一管理表现为由上级中心统一制定防病毒策略、发送查杀病毒命令、下达版本升级提示，并及时掌握全部系统中心（包含下级中心）的病毒分布情况等；分布管理表现为下级中心既可以在收到上级中心的命令后做出响应，也可以管理本级，并主动向上级中心发送请求和汇报信息，并且能够直接管理本级和任意下级的客户端。此外，高级企业版中还集成了网络防火墙功能，管理员通过控制台可以对瑞星客户端防火墙进行集中管理，监控客户端防火墙状态，读取和设置客户端防火墙的配置。客户端防火墙的攻击事件能实时/定时报告到系统中心。